Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Top1mtQ8R4U6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Top1mtQ8R4U6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1mtQ8R4U6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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