Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup35Q8R4R6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup35Q8R4R6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms