Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip5Q8R361 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms