Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E3

Vmn1r36, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r36Q8R2E3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r36Q8R2E3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r36Q8R2E3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms