Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg10Q8R1P4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms