Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pof1bQ8K4L4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pof1bQ8K4L4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms