Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms