Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssh3Q8K330 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms