Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6bQ8K2H2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6bQ8K2H2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6bQ8K2H2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6bQ8K2H2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otud6bQ8K2H2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otud6bQ8K2H2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otud6bQ8K2H2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6bQ8K2H2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud6bQ8K2H2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms