Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd3Q8K2F0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms