Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcf3Q8K268 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms