Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1eQ8K202 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms