Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms