Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scnm1Q8K136 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnm1Q8K136 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnm1Q8K136 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scnm1Q8K136 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scnm1Q8K136 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Scnm1Q8K136 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Scnm1Q8K136 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scnm1Q8K136 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scnm1Q8K136 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scnm1Q8K136 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Scnm1Q8K136 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scnm1Q8K136 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scnm1Q8K136 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scnm1Q8K136 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scnm1Q8K136 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scnm1Q8K136 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scnm1Q8K136 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scnm1Q8K136 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scnm1Q8K136 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scnm1Q8K136 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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