Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LgsnQ8CIX8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms