Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp2Q8CGR7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms