Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ercc8Q8CFD5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ercc8Q8CFD5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ercc8Q8CFD5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ercc8Q8CFD5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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