Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx8Q8CFD4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx8Q8CFD4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms