Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc9Q8CDN9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc9Q8CDN9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lrrc9Q8CDN9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lrrc9Q8CDN9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lrrc9Q8CDN9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms