Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riox2Q8CD15 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riox2Q8CD15 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms