Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pabpn1Q8CCS6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pabpn1Q8CCS6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms