Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Usp20Q8C6M1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp20Q8C6M1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Usp20Q8C6M1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp20Q8C6M1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Usp20Q8C6M1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp20Q8C6M1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp20Q8C6M1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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Usp20Q8C6M1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp20Q8C6M1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp20Q8C6M1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Usp20Q8C6M1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Usp20Q8C6M1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Usp20Q8C6M1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Usp20Q8C6M1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp20Q8C6M1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Usp20Q8C6M1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Usp20Q8C6M1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp20Q8C6M1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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