Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms