Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TiparpQ8C1B2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TiparpQ8C1B2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms