Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nek11Q8C0Q4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek11Q8C0Q4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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