Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms