Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip1Q8C079 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip1Q8C079 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip1Q8C079 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip1Q8C079 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip1Q8C079 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip1Q8C079 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip1Q8C079 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strip1Q8C079 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strip1Q8C079 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strip1Q8C079 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms