Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms