Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actrt3Q8BXF8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms