Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sall4Q8BX22 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sall4Q8BX22 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms