Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ctdsp2Q8BX07 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ctdsp2Q8BX07 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ctdsp2Q8BX07 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ctdsp2Q8BX07 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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