Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmod1Q8BVA4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms