Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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