Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gga3Q8BMI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gga3Q8BMI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gga3Q8BMI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gga3Q8BMI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gga3Q8BMI3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gga3Q8BMI3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms