Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me3Q8BMF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me3Q8BMF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms