Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMA6

Srp68, Signal recognition particle subunit SRP68, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp68Q8BMA6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp68Q8BMA6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp68Q8BMA6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp68Q8BMA6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp68Q8BMA6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp68Q8BMA6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp68Q8BMA6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms