Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hirip3Q8BLH7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hirip3Q8BLH7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hirip3Q8BLH7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms