Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpc2Q8BKV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms