Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
D130040H23RikQ8BII3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D130040H23RikQ8BII3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms