Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp4f39Q8BGU0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp4f39Q8BGU0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms