Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2bQ8BG39 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2bQ8BG39 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms