Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnpo1Q8BFY9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms