Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srgap3Q812A2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srgap3Q812A2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms