Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg4cQ811C2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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