Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc50Q810U5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms