Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Kdm5bQ80Y84 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm5bQ80Y84 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms