Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ttc28Q80XJ3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ttc28Q80XJ3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ttc28Q80XJ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ttc28Q80XJ3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc28Q80XJ3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ttc28Q80XJ3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ttc28Q80XJ3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ttc28Q80XJ3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttc28Q80XJ3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc28Q80XJ3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc28Q80XJ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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