Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hapln4Q80WM4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms