Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms