Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG6

Alkal2, ALK and LTK ligand 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal2Q80UG6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkal2Q80UG6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms